Do sự thay đổi trong cấu trúc di truyền của người bị hội chứng Down. Cụ thể, họ thường có ba bản sao của nhiễm sắc thể 21 (trisomy 21), thay vì hai bản sao như người bình thường. Sự thay đổi này ảnh hưởng đến sự phát triển của các cơ quan và mô trong cơ thể, bao gồm cả khuôn mặt